水工结构研究所

      1）高坝与坝基安全监控理论、方法和技术；
      2）坝工设计计算理论与试验技术；
      3）高边坡及地下工程；
      4）大型水闸、船闸及输水结构；
      5）水工混凝土结构及新材料。

水力学及河流研究所

      1）工程水力学理论与应用；
      2）水沙运动理论与工程应用；
      3）河流管理与生态环境；
      4）工程渗流及地下水；
      5）计算水力学与水信息技术。

水利水电工程研究所

      1）水利水电系统规划与优化调度；
      2）水电站/泵站水力学；
      3）水电站/泵站结构；
      4）水力机组过渡过程；
      5）抽水蓄能及新能源技术；
      6）水利经济与管理。

农业环境研究所

      1）水土保持与水土环境保护；
      2）环境生物技术；
      3）设施农业环境控制；
      4）作物水肥协作效应；
      5）灌溉排水的生态环境效应。